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A la découverte de Linux

Introduction

L’équipe pédagogique
Le cluster de l’IFB
C’est quoi JupyterHub
Comment converser avec le terminal ?
Charger l’environnement logiciel
Prototype(s) d’une commande
Quizz 1
Fiches de révision

Arborescence

Arborescence de fichiers
Stockage fichiers
Manipuler des fichiers
Redirections
Quelques bonnes pratiques…
Quizz 2

Qualité des lectures

Jeu de données
Analyser la qualité avec fastQC
Rogner les reads

Read mapping

Mapping
Arrêter le serveur Jupyterhub

Ressources

Les raccourcis clavier du terminal
Formats
Markdown
Pourquoi ça plante ?
Glossaire
Index

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By Thomas Denecker & Claire Toffano-Nioche

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