Chapter 3 Comment utiliser R ?

3.1 Modes d’utilisation (liste non exhaustive)

  • Localement via le terminal
  • Localement via RStudio (utilisation classique)
  • Sur un serveur via le terminal et une connexion ssh
  • Sur un serveur via un navigateur web pour accéder à RStudio server
  • Sur un serveur via un navigateur web pour accéder à RStudio server par Jupyter

3.2 Ouverture ou connexion à RStudio

3 alternatives :

  1. Ouvrir RStudio sur votre propre ordinateur (si installé)

  2. Vous connecter au serveur Web RStudio de l’IFB https://rstudio.cluster.france-bioinformatique.fr puis vous identifier

  1. Vous connecter via Jupyter lab de l’IFB https://jupyterhub.cluster.france-bioinformatique.fr puis cliquer sur l’icône RStudio

3.3 RStudio

  • Disponible depuis 2011
  • Logiciel facilitant l’utilisation de R via 4 panneaux
  • Chaque panneau présente plusieurs onglets (fonctionnalités complémentaires)