Programme

Module 1

1. Activité Brise Glace
2. Crise de reproductibilité
3. Vers FAIR
4. Cycle de vie des données
5. Le plan de gestion des données
6. Opidor

Module 2

1. Introduction
2. Le nommage des fichiers
3. Format de fichier
4. Stockage et accès
5. Outils et solution

Module 3

1. Introduction aux métadonnées
2. Life science standards and ENA submission
3. Choix des métadonnées et soumission à l'EBI

Module 4

1. Cadre Juridique
2. Les licences sur les données
3. Quel entrepôt pour quelles données ?

Module 5

1. Fin du PGD
2. Débrief de la formation
3. Quizz
4. Questionnaire

Formateurs

Informations générales de l’édition

Cette édition a pour objectif de tester le contenu pédagogique sur un public ciblé.

Localisation

Chez nous !

Les participants

Photos de la formation

Les créations lors de l’édition

Module 1

Quelle définition pour les données de la recherche ?

Quand ? Module 1 - Séquence 2

Outils utilisé : scrumblr

Groupe 1

Proposition : “Numérisation d’un signal issu d’observation avec métadonnées associées incluant les transformations méthodologiques”

Groupe 2

Proposition : “Définition OCDE, avec les technologies actuelles, génération massive de données qui va au delà de ce qui est strictement nécessaire pour les résultats de la recherche. Donc : ‘réparer’ la crise de repro. Exemple : données perdues, non utilisés”

Groupe 3

Proposition : “On est partis sur différents axes, d’un côté les types de données (audio, video, qualitatif, quantitatif,…), origine de la donnée, est-ce que les outils sont considérées comme des données de la recherche. Lien entre donnée/interprétation/connaissance. FAIR”

Réutiliser les données? Où est le problème?

Retours sur la vidéo

• Points positifs
  • Les données ont été retrouvées et il y avait une copie et la clé USB était possible à lire, il y avait quelques premières métadonnées
• Points négatifs
  • Données non sécurisées ;
  • Pas de metadonnées ;
  • Format propriétaire du logiciel ;
  • Pas d’anticipation.

Quelles conditions pour que les données soient réutilisables ?

Quand ? Module 1 - Séquence 3

Outils utilisé : Mentimeter

Les points d’attention à avoir le long d’un projet, de sa conception jusqu’à sa valorisation

Quand ? Module 1 - Séquence 4

Outils utilisé : scrumblr

Module 2

Formats et logiciel ?

Quand ? Module 2 - Séquence 3

Outils utilisé : scrumblr

Outils et solution : vous utilisez quoi ?

Quand ? Module 2 - Séquence 5

Outils utilisé : scrumblr

Où se situe mon fichier ?

Quand ? Module 2 - Séquence 4

Outils utilisé : chart.js

show/hide all

Module 3

What do you know as standard in life sciences ?

Quand ? Module 3 - Séquence 2

Outils utilisé : scrumblr

Source : xkcd

Find the Genomics Standard Consortium (GSC) used by both ENA and SRA databases in the FAIRsharing resource

Quand ? Module 3 - Séquence 3

Module 4

Connaissez vous des entrepôts de données ?

Quand ? Module 4 - Séquence 2

Outils utilisé : scrumblr

Module 5

Résultats du questionnaire

Quand ? Module 5 - Séquence 4

Liens utiles

• https://pgd17juin2019.sciencesconf.org/program
• https://fairsharing.org/databases/
• https://www.nature.com/sdata/policies/repositories
• http://about.zenodo.org
• https://search.datacite.org/data-centers
• https://cordis.europa.eu/project/rcn/207500/
• https://ds-wizard.org