*** Prolongation des inscriptions au 8 décembre ***

Journée MaDICS-ReproVirtuFlow 2017

12 décembre 2017

Amphithéatre du bâtiment 21, Campus CNRS, Gif-sur-Yvette

Plan d’accès

Contexte

L’objectif de cette journée est de présenter les activités de l’action ReproVirtuFlow, fondée et soutenue par le GDR MaDICS, qui s’intéresse à la problématique de reproductibilité computationnelle.

Face aux masses de données disponibles, à la multitude d’outils existants et à la complexité des analyse de données scientifiques, reproduire une expérience in-silico est une tâche particulièrement difficile. ReProVirtuFlow vise à faire un état des lieux (besoins et solutions) et à expérimenter les approches existantes, tirant partie de retours d’expérience multiples pour tendre vers la définition de bonnes pratiques. Notre consortium regroupe des experts en Base de Données, Développement Logiciel et Environnements Virtuels, ayant une longue expérience dans l’analyse de données à grande échelle. Il comporte aussi des responsables et utilisateurs de plateformes produisant et exploitant des données de diverses natures.

Les activités que nous avons menées durant les deux premières années de cette action nous ont permis de comprendre le paysage de la reproductibilité computationnelle en particulier lorsque les traitements de données sont effectués à l’aide de systèmes de workflows scientifiques.

La journée du 12 décembre 2017 présentera l’état de l’art que nous avons effectué des différents éléments de solutions disponibles à la communauté bioinformatique pour tendre vers une meilleure reproductibilité des analyses de données bioinformatiques. Elle comportera des retours d’expériences d’utilisateurs d’outils aidant à la reproductibilité computationnelle. En particulier, nous présenterons les résultats que nous avons obtenus au premier ReproHackathon organisé par notre groupe dans lequel plusieurs équipes ont cherché à reproduire les résultats d’une publication scientifique (voir le site du premier ReproHackathon). Notre journée comportera enfin des présentations sur les approches émergentes dans le domaine de la reproductibilité.

Programme

Inscription

L’inscription est gratuite mais obligatoire et doit être effectuée avant le 8 décembre. Pour vous inscrire il convient de vous inscrire d’abord au GDR MaDICS (merci de suivre les instructions sur le site).

Formulaire d’inscription

La journée ReproVirtuFlow 2017 est soutenue par le GDR MaDICS, par le groupe Psay CompBio de l’Université Paris-Saclay et par l’Institut Français de Bioinformatique.

MaDICS Paris-Saclay IFB